了解項目申請報告與可行性研究報告的區別，可以有針對性地開展項目的決策及核准申請準備工作，提高工作質量和效率。一般來說，項目申請報告與可行性研究報告的有如下的區別：
1.目的與作用的區別
     投資項目的可行性研究報告是投資決策的重要依據，進行項目可行性研究的過程，也是優化和初步確定項目的市場、技術、經濟、經營管理方案和實施方案的過程。可行性研究報告所確定的市場、技術、經濟等方案是項目實施和進行工程設計的基礎和依據。
     編制項目申請報告的目的，是提供政府按核准制核准項目所需提供的文件，為政府從維護經濟安全、合理開發利用資源、保護生態環境、優化重大佈局、保障公共利益、防止出現壟斷等方面進行審查提供依據。
2.內容的區別
     可行性研究報告的主要內容包括：項目的意義和建設的必要性；市場預測分析；項目規模及產品方案；工藝技術方案；原材料及動力供應；建設條件和場址選擇；總圖運輸；公用工程及輔助設施；節能節水；消防；環境保護；勞動安全衛生；組織機構及人員配置；項目實施計劃；投資估算及資金籌措；財務及經濟效益分析；研究結論等方面的內容。
     根據國家發改委《國家發展改革委關於發布項目申請報告通用文本的通知》（發改投資【2007】1169號），項目申請報告的主要內容包括：申報單位及項目概況；發展規劃、產業政策和行業准入分析；資源開發及綜合利用分析；節能方案分析；建設用地、徵地拆遷及移民安置分析；環境和生態影響分析；經濟影響分析；社會影響分析。對於專項或專題的項目申請報告，還需根據專項或專題要求，結合項目的實際情況，進行適當調整。
3.編制角度的區別
     可行性研究報告主要從企業（投資者）的角度出發，研究項目在市場、技術、安全環保、經濟等方面的可行性，因而需要就項目的各個方面進行深入細緻的調查研究，並提出明確的方案；而項目申請報告則主要從宏觀的角度，向政府部門說明項目對社會、經濟、資源、環境等方面的影響和貢獻，對有關市場、技術、經濟等方面的方案，作簡要的介紹和說明即可。
4.受國家法規約束程度的區別
     項目申請報告的編制具有強制性，根據國家《企業投資核准暫行辦法》、《外商投資項目核准暫行管理辦法》、《境外投資項目核准暫行辦法》等國家法規的規定，需要由國家或地方政府核准的項目，必須編報項目申請報告。而且，項目申請報告受國家和各級政府部門的法規的製約，必須反映國家和地方政府的政策和對投資的引導及約束，其內容和深度必須滿足政府核准的要求。
     可行性研究報告的編制雖然也要執行國家和地方的法規及產業政策，但其側重點不同，其更多地體現了投資者的要求和利益。除了國家、集體投資、出資或一些特別的項目（如涉及危險化學品的項目），可行性研究報告不是企業決策的法定文件，其強制性程度較低。可行性研究報告的內容深度一般執行行業的規定，也可按照投資者的要求進行編制。
5.時序上的區別
     一般來說，項目申請報告是在可行性研究的基礎上編制的獨立文件，需要在申請政府核准項目時提供。二者在時序上有先後的區別。
6.對編制單位要求的區別
     由於項目申請報告具有較強的政策性，不是站在項目建設單位的角度，而是側重從社會和公共利益的角度考慮，一般不宜由投資者自行編制，應委託有工程諮詢資質的諮詢機構編制。